A mikroökológiai egyensúlyt befolyásoló fő tényezőket a környezet, a gazdaszervezet és a mikrobák három szempontjaként lehet összefoglalni.
A levegőszennyezés, az éghajlatváltozás, a takarmány és az ivóvíz romlása, a szennyezés és más külső tényezők, a gazdaszervezet diszfunkciós és anyagcsere -rendellenességekhez vezethetnek, befolyásolva a mikrobiális növényvilágot és a kolonizációs állapot mutációt. Mint például a csökkentett környezeti hőmérséklet, csökkentheti a bél bifidobaktériumait.
A gazdaszervezet immunfunkciója fontos tényező az invazív támadások elleni küzdelemben és a gazdaszervezet védelmének képességének javításában, és fontos rendszer az endotoxin eltávolításához is, amely csökkenti a mikrobiális egyensúlyhiányt, amikor immunszuppresszív és immunszuppresszív. A gazdaszervezet fiziológiai funkciója, például a gyomorsavszekréció, az epet szekréció, a rendellenes bélmozgások, szintén mikro-ökológiai rendellenességekhez vezetnek.
Az antibiotikumok fontos tényezőt jelentenek a növényvilág egyensúlyhiányának, az ökológiai egyensúly súlyos károsodásában, ami a gazdaflóri gát elvesztéséhez, a biológiai antagonizmus elvesztéséhez, az endogén kórokozóknak és az exogén kórokozók tömegszaporodásához vezet.